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此刻，穿越了常磐森林旅行到尼比市的小智和小霞，选择在常磐市的精灵中心休息。看到常磐市精灵中心的联盟比赛海报，小智决定参加比赛。
尼比市的岩石道馆就成为了小智第一个要挑战的道馆。当然，以小智现在的实力想要打败尼比市的道馆主是件很困难的事，在尼比市道馆馆主小刚的父亲，武能先生的帮助下小智打败了小刚，于是小刚决定和小智一起出去旅行。
不过跟随小智一起旅行的小刚可不是以训练家为目标，而是以饲育家为方向。在旅行中见识各种小精灵，了解它们的习性。
在尼比市休整了几天的小智再次踏上旅途，这次就是三个人一同旅行了。在小智没有修复完毕小霞的脚踏车之前，小霞会一直跟着小智，而尼比市道馆主的身份，小刚也让给了自己父亲，武能先生。
与此同时，收到张玉资料和援助的武藏，小次郎和喵喵在尼比市边上的月见山寻找皮皮和巨大的月亮石。
她们在月见山的洞窟中拉起了电灯，将原本生活在洞窟深处的大嘴蝠赶了出去。
可是经过几天的寻找却依然没有发现张玉所说的巨大月亮石和皮皮。
没有耐心的武藏冲着喵喵和小次郎说着自己的怀疑。
“你们两说这里有鬼玉队长说的那个什么巨大月亮石和聚集起来的皮皮吗？要知道我们可是在这破月见山里面挖了几天了，月亮石连根毛都没见到。
不过还好有些别的矿石可以卖钱，也不算太亏。要是没有月亮石，我们还不如继续去找珍贵的小精灵献给老大，这样就会获得老大的赏识。
想想看吧，升职加薪都不再是梦想，当上了重要人物，就会有花不完的钱，每天只要负责美美的就好了。啊！那是多么惬意的日子啊！”
听着武藏的长篇大论，在一旁卖力挖掘的喵喵和小次郎双目相对，眼神交流了一番，选择无视武藏的美梦。
没等到自己想要的反馈，武藏追着小次郎想要得到自己想要的回答。
一旁的喵喵害怕殃及池鱼，连忙闪到一边去。
喵喵刚一闪到边上，就发现一只皮皮抱着一块小块月亮石的碎片在观察相互拉扯的武藏和小次郎，这两个人的争斗吸引了皮皮的注意力。
看到皮皮的喵喵赶紧通知武藏和小次郎。
“你俩赶紧别打了，皮皮出现了，手里还有月亮石呢，看来鬼玉队长没有骗我们，真的有这些东西，现在赶紧抓住皮皮，拷问巨大的月亮石在哪里。”
正在拉扯的武藏和小次郎听到喵喵的呼喊，赶紧停手回头，就看到皮皮正抱着月亮石碎片看自己的表演，于是两个人赶紧松开，转身要去抓捕皮皮。
没有工具的情况下，人类想要抓捕野生的小精灵可不容易，看到停止拉扯的武藏和小次郎朝自己走来，皮皮转身就跑，野生的小精灵可不是那么好接近的。
于是三个人和皮皮就开始了追逐竞赛。
矿洞里面狭窄矮小，人类这么大的体型实在不容易施展开来，因此灵活的皮皮，在周围突出的岩石上面一跳一跳的就逃走了，只有喵喵能勉强跟得上节奏，武藏和小次郎两个人只能跟在后面吃屁。
从尼比市启程的小智一行此时也到达了月见山洞窟的入口处，远远的就看到有一群大嘴蝠在洞口处攻击着一个身穿白色褂子的人。
走上前，帮忙驱散开攻击的大嘴蝠，将双手抱头，缩在地上的人拉起来，一番交流之后得知，这个人是尼比市科学博物馆的研究员，叫做李科，来月见山是为了守护沉眠在月见山之中的月亮石。
自从月亮石可以加强小精灵的力量的报告问世之后，来自各地的人们就来月见山寻找月亮石，却都一无所获。
因为这些人的缘故，大嘴蝠才会从洞穴深处被赶出来，然后失常攻击人类的。一路上，小智等人还看到将自己身上的蘑菇种在地上的派拉丝和快要脱水的穿山鼠。
跟随着李科一边往洞穴深处前进，一边听李科说自己的理念。
李科认为小精灵都是宇宙的产物，全部是坐宇宙飞船来到小精灵世界的。
正在李科热烈的讲解中，皮皮抱着月亮石碎片从他们身边经过。
发现野生的皮皮，立志要做伟大小精灵训练家的小智怎么会错过，因此小智就想要追上去收服皮皮。
跟上去之后就发现，皮皮被喵喵压迫到一个角落，想要制止喵喵的小智，拿出自己的精灵球，正准备发动攻击。
跟在后面的武藏和小次郎这个时候也赶上来了。
小智和小刚拖住武藏和小次郎，找书苑 www.zhaoshｕyuan.ｃom 让皮皮先逃走，然后自己来对付武藏和小次郎。
一番战斗之后，武藏和小次郎就被怼上了天空。
而小霞和李科跟着皮皮跑出了洞窟，喵喵在发生战斗之时，跟着皮皮也跑了出去。
在洞窟外面的小溪中，小霞将喵喵打跑。
于是安全了的小智一行，跟着皮皮来到了皮皮聚集的地方，那只抱着月亮石碎片的皮皮将碎片放在了巨大月亮石的边上，跳起了神秘的舞蹈。
一直寻找不到皮皮聚集地的武藏和小次郎还有喵喵在小智的作用下，终于发现隐藏起来的巨大月亮石。
武藏她们明修栈道暗度陈仓，召唤出来瓦斯弹和阿柏蛇。
看到武藏她们率先使用小精灵，小智等人也召唤出来自己的小精灵准备应战，不料，瓦斯弹释放烟幕，掩护阿柏蛇使出打洞绝招，在巨大月亮石的底下，打出了一条地道。
巨大月亮石顺着地道就到了事前准备好的地方。
武藏，小次郎和喵喵也趁着机会逃走了。
没有其他外力因素的情况下，武藏，小次郎和喵喵这个火箭队三人组，无论计划多么完美，最终只会导向一个Bad End！那就是失败！
看过的所有动画告诉我们，面对小智，三人组永远扑街！
所以，即使有准备的三人组将月亮石运走了，可是在半路还是被小智一行给截住了。
在皮皮们的挥指功之下，又一次被怼到了天空。
解决了事情的小智一行，和皮皮李科他们告别，踏上了前往下一个道馆的路。
